Además de los libros Espejito, espejito y Que planche Rosa Luxemburgo, Francisca Aguirre ha publicado los libros de poesía Ítaca, Los trescientos escalones, La otra música, Ensayo general, Pavana del desasosiego, Los maestros cantores, (todos ellos reunidos en Ensayo general. Poesía completa 19662000. Calambur, Madrid, 2000) y La herida absurda. En Nanas para dormir desperdicios la cicatriz, el pingo, los cordones de los zapatos, las tachaduras, la ceniza, los libros viejos y las mondas de las patatas se convierten en criaturas que dicen su canción en el silencio de los años y llenan de sentido el pasado, el presente y la extrañeza de la vida. Nanas para dormir desperdicios es un libro sigilosamente asombroso, musical y conmovedor.
Autora de once libros de poemas, aparte de antologías y recopilaciones, en su obra destaca su tardío debut (Ítaca, publicado cuando su autora contaba con cuarenta y dos años), Pavana del desasosiego o Historia de una anatomía (por el que recibió en 2012 el Premio Nacional de Poesía). Es autora también del libro de cuentos Que planche Rosa Luxemburgo y de los recuerdos recogidos en Espejito, espejito. En 2018 gana el Premio Nacional de las Letras que otorga el Ministerio de Cultura y Deporte.