Malaqa es una novela ambientada en dos épocas distintas de la ciudad de Málaga: la conquista de ésta por los Reyes Católicos y la actual durante la construcción del metro urbano.
La Historia se inicia en el siglo XV con la llegada de Lorenzo de Sepúlveda, encargado por el cadí de Malaqa para el rescate del sobrino de éste de las cárceles de Orán.
Continúa en la actualidad cuando los operarios del metro descubren un habitáculo enterrado y las autoridades locales deciden realizar un estudio del mismo, dando lugar a un misterioso incidente que provocará una serie de crímenes inexplicables para la policía.
Ambas historias transcurren en una dinámica que incita al lector a descubrir la relación entre ellas y a comprender cómo los protagonistas se ven envueltos, sin querer, en algo que cambiará sus vidas para siempre.