El Padre Edelmiro, párroco de la iglesia ecuatoriana de Santa Úrsula, es trasladado en estado de coma al Hospital de Nuestra Señora del Buen Amparo de Puyo por los indios a quienes ayuda como misionero. El enfermero encargado de atenderle, Óscar Ponce de León, comienza a urdir una trama de engaño y beneficio propio en ese mismo centro hospitalario donde trabaja, haciendo creer a los ecuatorianos que se comunica espiritualmente con el nuevo Hijo Pequeño de Dios: el religioso inconsciente Edelmiro Gutiérrez. Ayudado de cómplices y documentación bibliográfica, el enfermero convencerá a los inocentes indios de que se aproxima «La Segunda lenida» y de que para poder conseguir la salvación divina hay que seguir los pasos de la Iglesia de Amurí. Ésta no es otra cosa que una secta cuyo único fin es servir de tapadera para el aprovechamiento económico, social y humano que su líder, el enfermero Óscar Ponce León, realizará sobre los fieles. Convertido un tiempo después en salvador para unos pocos indios y en delincuente para la sociedad que se percata de la mentira, los Amuritas viajan a España para continuar con su plan de extender la supuesta «palabra de Dios», hasta que el negocio adquiere suficiente importancia y comienza a estar bajo sospecha, incluso protagonizando programas televisivos. Pilar Salarrullana, quien fuera definida como «posiblemente hoy, en España, la primera autoridad en esta materia» por sus trabajos de investigación sobre sectas religiosas destructivas, ha creado en La Segunda Venida una trama en la que presenta y critica la gestación de una secta y el daño que éstas causan a las personas que captan. Desde su inicio hasta sus últimas consecuencias, Salarrullana ha bordado una novela en la que la condición humana es protagonista en su peor condición. Con conciencia de saber de lo que se está escribiendo y con el fin de conocer mejor el oscuro mundo de las sectas, La Segunda Venida nos acerca a las humanas garras sin escrúpulos ni sentimientos.
